敏捷制造下MES的基本功能及其地位并没有改变，但是其表现的特点与传统MES是有显著差别的。在敏捷制造模式下，车间的功能在制造企业中逐渐向分厂制过渡，当车间的任务不能完成时，可以直接通过网络在网上寻求合作伙伴，构成一个虚拟车间，另一方面，车间级也可以直接接受其他车间或企业的生产任务，作为其他企业的虚拟车间或企业的一部分。
在这种虚拟性的企业中，管理模式将由分层递阶向扁平化发展，生产指令不再是自上而下的传达过程，而是由订单驱动来安排各自的生产任务，因此，每个制造单元的相互协调就显得越来越重要，同时，业务过程的不断变化要求MES具有良好的“柔性”。传统MES无法满足敏捷制造单元的信息管理。企业迫切需要新一代的MES解决方案。
可集成MES（Intergratable MES，I-MES）可以说是面向敏捷制造的新一代MES，它既是对传统MES的扬弃，又具有鲜明的敏捷性特征。可集成MES通过运用可重用组件进行系统快速装配，一方面可提供专用的MES系统的特定功能，即可集成MES中的部分功能作为可重用组件单独销售，另一方面它又能够按照客户的需求实现系统的快速组装形成集成的MES，实现上下两层之间的集成。面向敏捷制造的MES具有以下几点特征：

（1）可集成性
实现与不同厂商之间系统的集成以及对企业现有系统的保护。
（2）可配置性
敏捷制造的MES能够对工厂新引入的产品，以及不可预料的需求变化进行系统结构的快速配置，来满足用户不断变化的需求。
（3）可适应性
通过系统良好的重构能力来自动适应变化的工作负荷和条件或者业务过程的改变。
（4）可扩展性
敏捷制造的MES不但可以在一个单元内扩展其功能，还可以扩展到其它制造单元以及产品制造生命周期的其它阶段，从而满足各种复杂的制造需求。
（5）可靠性
保证分布式系统的数据完整性、一致性以及虚拟企业信息交互的安全性。

那么，实施敏捷制造下的MES，将会以合理的机制充分利用企业的资源与技术，以适当的方式集成产品开发和生产制造等要素，实现资源的动态优化配置。